Isso acontece pq mesmo instalando os apps no SD, seus dados ficam na memória interna, ocupando espaço.
A bíblia off line JFA, por exemplo, tem menos de 1 mega de tamanho, mas depois de aberta a primeira vez, vai pra mais de 8Mb. Limpando os dados, ela volta pra 1Mb.
Baixe o titaniun backup e limpe o cache de todos os apps em massa, e os dados também, que é o que ocupa realmente espaço.
Cuidado com os dados que irá apagar. Aproveite e desinstale alguns apps do sistema.
